Iori Shijima est un lycéen ordinaire qui a acquis un pouvoir extraordinaire, celui d'exaucer tous ses vœux. Ce don du ciel est dû à l'Atrail, un mystérieux objet cubique, avec lequel le jeune homme est le seul à être capable de communiquer, ce qui lui vaut d'être à la fois jalousé et courtisé. Mais un beau jour, un dénommé Kanan apparaît devant Iori et affirme être lui aussi capable d'interagir avec l'Atrail. Iori doit-il se battre pour conserver le contrôle exclusif de l'Atrail ? Ou préférera-t-il se défaire de cet objet encombrant qui l'empêche de retourner à sa vie plan-plan d'avant ?
Après son combat épique contre Kanan, Iori comptait retourner à sa vie ordinaire et retrouver son train-train quotidien. Mais le monde entier a été témoin de sa puissance qui a entraîné des cataclysmes un peu partout et un bouleversement politique inattendu. En effet, les deux clans rivaux qui se disputaient le contrôle de la planète jusqu'à présent, ont été unifiés au sein de la toute nouvelle “Alliance du progrès”. Pour Ruri, Amadeus et Faï, l'heure du choix a sonné. Vont-ils rallier la toute nouvelle structure qui gouverne le monde ? Ou vont-ils rester fidèles à Iori ?
Une mère aimante, des camarades sympas, des journées bien planifiées... Tel était le quotidien d'Iori Shijima, un lycée ordinaire qui n'aspirait qu'à une vie normale. Mais c'était sans compter sur l'apparition soudaine dans le ciel de "l'Atrail", un mystérieux objet cubique qui viendra bouleverser son univers jusque-là sans turbulences. Pris dans une tempête de révélations sur sa personne, Iori va devoir faire face à des défis qui le dépassent et sauver le destin de l'humanité...